İşeri Lab:
Kanser kemoterapisine karşı gelişen dirençliliğinin moleküler mekanizmaları ve geri çevrilmesi, farklı ajanlara hücresel cevapların ve antikarsinojenik potansiyellerinin değerlendirilmesi, kanser tedavisinde nanoteknolojik yaklaşımlar, EV'lerin kanser tanı ve tedavisinde kullanımı ile bitkilerde stresin moleküler mekanizmaları İşeri Lab'ın çalışma alanlarındandır.
Eyidoğan Lab (Bitki Moleküler Biyolojisi, Fonksiyonel Genomik ve Tarımsal Biyoteknoloji Araştırma Grubu):
Prof. Dr. Füsun Eyidoğan liderliğinde çalışmalarını sürdüren Eyidoğan Lab, Dr. Öğr. Üyesi F. Şeyma Gökdemir’in araştırma koordinasyonu ve katkılarıyla bitkilerde abiyotik ve biyotik stres yanıtlarının moleküler, fizyolojik ve biyoinformatik düzeyde incelenmesine odaklanmaktadır. Araştırma grubumuz; bitki stres fizyolojisi, fonksiyonel genomik, tarımsal biyoteknoloji, alg biyoteknolojisi, gen ailelerinin genom çapında karakterizasyonu, transkriptomik analizler, miRNA çalışmaları, bitki-mikroorganizma etkileşimleri ve sürdürülebilir tarıma yönelik moleküler yaklaşımlar üzerine çalışmalar yürütmektedir. Güncel olarak grubumuzda 10 lisans ve 2 yüksek lisans öğrencisi aktif olarak araştırma projelerinde yer almaktadır.
Kayıhan Lab:
Bitki moleküler biyolojisi, bitki biyoteknolojisi ve moleküler tarım alanlarına odaklanmakta olup, özellikle bitkilerin çevresel streslere verdikleri yanıtların fizyolojik, biyokimyasal, transkriptomik ve tek hücre düzeylerinde anlaşılmasına önem vermektedir. Araştırmalarımız, özellikle bor toksisitesi, kuraklık ve tuzluluk gibi abiyotik streslere karşı toleransın altında yatan moleküler mekanizmaları ortaya çıkarmayı amaçlamakta ve bu amaçla model bitki olan Arabidopsis thaliana kullanılmaktadır.Ayrıca, bitki bazlı ekspresyon platformu kullanılarak SARS-CoV-2’ye karşı ikinci nesil, çok epitoplu ve homolog virüs benzeri partikül (VLP) temelli aşı adayının geliştirilmesine de odaklanmaktayız; bu da moleküler tarım araştırma hattımızı güçlendirmektedir.
Omik teknolojilerin, gen ekspresyon analizlerinin, tek hücre RNA dizilemenin ve moleküler klonlama yaklaşımlarının entegrasyonu ile grubumuz; stres yanıtlı genleri, düzenleyici yolakları ve biyoteknolojik stratejileri tanımlamayı hedeflemektedir. Bu çalışmalar, daha dayanıklı bitkilerin geliştirilmesine ve aşı adayları da dahil olmak üzere değerli biyomoleküllerin üretimi için sürdürülebilir bitki bazlı platformların oluşturulmasına katkı sağlamayı amaçlamaktadır.
Erdemli Lab:
Erdemli Lab, biyomalzemeler, ilaç taşıma sistemleri, nanoteknoloji ve doku mühendisliği alanlarına odaklanan multidisipliner bir araştırma grubudur. Araştırmalarımız, bitki ve hayvan dokularından protein ve polisakkaritlerin izolasyonuna dayanarak hidrojeller ve filmler gibi ileri biyomalzemelerin geliştirilmesini kapsamaktadır. Nanoteknoloji alanında ise metal nanopartiküllerin üretimi için bitki ekstraktları aracılığıyla gerçekleştirilen yeşil sentez yöntemlerini kullanmaktayız. Çalışmalarımız, fizikokimyasal özelliklerin karakterizasyonu ile malzeme–hücre etkileşimlerinin in vitro düzeyde incelenmesine odaklanmaktadır.
Moleküler Filogenetik ve Evrim Araştırma Laboratuvarı:
Doğu Akdeniz su kurbağası kompleksi (Cins: Pelophylax), filogeni, filocoğrafya ve moleküler sistematik çalışmaları için model grup olarak kullanılmakta; ayrıca mitokondriyal ve nükleer genlerin moleküler evrimi araştırılmaktadır. Bunun yanı sıra araştırma grubu, kelaynak, kara akbaba, alageyik, boz ayı, Anadolu parsı ve Anadolu’daki Yakın Doğu ateş semenderi alttürleri gibi nesli tehlike altında veya tehdit altındaki çeşitli türlerin popülasyon genetiği ve filogenisi üzerine çalışmalar yürütmektedir. Grup ayrıca su kurbağaları ve kuşlarda cinsiyet genlerinin evrimi üzerine de araştırmalar yapmaktadır.
Akbulut Lab:
Kanser biyolojisi ve ilaç yeniden konumlandırma alanında translasyonel ve çok disiplinli araştırmalar yürütmektedir. Küçük moleküller ve doğal bileşiklerin antitümör etkileri, hücresel ve moleküler düzeyde fonksiyonel olarak değerlendirilmektedir. Biyoinformatik ve deneysel yaklaşımlar entegre edilerek kanser progresyonu ile ilişkili sinyal yolakları ve terapötik yanıt mekanizmaları araştırılmaktadır.
Balcı Lab:
Genetik ve mikrobiyolojik hastalıkların tanısında kullanılabilecek nükleik asit analiz cihazları ve bu cihazlara uyumlu tanı kitleri geliştirilmektedir. Geliştirilen cihazların ve kitlerin doğrulaması kapsamında eşik değeri, analitik duyarlılık, analitik özgüllük, lineer aralık, tekrarlanabilirlik, klinik duyarlılık ve klinik özgüllük çalışmaları yürütülmektedir.
Gökçınar Lab:
Özellikle göbek kordonundan mezenkimal kök hücre izolasyonu, kültürü ve tanımlanması sonrası bu hücrelerin davranışlarını incelemektedir. Mezenkimal kök hücrelerin keratinosit ve kardiyomiyosit gibi dokuya özel hücrelere farklılaşmaları sırasında farklı bileşiklerin etkilerine bakılmaktadır. Hücre tabaka mühendisliği yaklaşımıyla doku benzeri yapıların oluşturulması ve hücrelerin birbirleriyle ilişkilerinin incelenmesi hedeflenmektedir.
Güleç Lab (Kanser Metabolizması ve Kemoterapi Yanıtı):
Laboratuvarımız, özellikle kanser hücrelerinde lipid metabolizmasının düzensizleşmesi olmak üzere metabolik plastisitenin, kemoterapötik tedavilere verilen yanıtın azalmasına nasıl katkıda bulunduğunu araştırmaktadır. Ayrıca bu direnci aşabilecek ve tedavi etkinliğini yeniden sağlayabilecek hedefe yönelik metabolik müdahaleleri belirlemeyi ve geliştirmeyi amaçlamaktadır.
Zabcı Lab:
Moleküler biyokimya ve yapısal biyoloji alanlarında, özellikle amiloid protein agregasyonunun önlenmesine odaklanmaktadır. Küçük ısı şoku proteinlerinin agregasyon üzerindeki düzenleyici rolü, rekombinant protein üretimi ve biyofiziksel yaklaşımlar kullanılarak incelenmektedir. Amacımız, nörodejeneratif hastalıkların moleküler mekanizmalarının daha iyi anlaşılmasına katkı sağlamaktır.
